Shiki Tohno, un prodigioso estudiante de secundaria de 17 años, dotado de una misteriosa habilidad para ver las [Lineas de la Muerte], las cuales, cuando son cortadas, destruyen el objeto.
Luego de la muerte de su padre, Makihisa, Shiki regresa a la Mansion Tohno a vivir con su hermana, Akiha Tohno.
Mientras camina a casa de regreso pasa por un parque donde ve a una chica, a la cual se siente extrañamente atraído, Shiki la sigue y sorprendentemente la descuartiza en 17 pedazos. Al terminar, Shiki, imprevistamente se desmaya.
Al día siguiente Shiki duda sobre si lo que paso fue real o un sueñocuando regresa Shiki encuentra a la chica que había descuartizado el día anterior (Arcueid), ahora tiene que ayudarla por lo que le hizo usando sus habilidades.