Hace un año, una nave espacial alienígena se estrelló en la Bahía de Tokio. Como no podían volver a casa, los alienígenas recibieron la ciudadanía japonesa. Ellos fueron llamados DearS, que significa Queridos amigos. Con el fin de estudiar el idioma japonés y las costumbres, se incorporaron al sistema terrícola.

Un día, Ikuhara Takeya, estudiante de secundaria se encuentra con una DearS que llevaba nada más que una manta. Debido al hambre, se derrumba en la calle. Pasa una vergüenza, no tiene más remedio que llevar este aliens, a quien más tarde le da el nombre de Ren, y pasa la noche en su apartamento. Ella insiste en quedarse, al referirse a Takeya como Amo. Ren aprende japonés durante la noche debido a su raza la cual posee gran inteligencia y capacidad lingüística y con la ayuda de Neneko, amiga de la infancia de Takeya y también hija del gerente del apartamento.

Más tarde, Ren va a asistir a la escuela de Takeya, donde es confundido con otro estudiante de intercambio DearS. Sin embargo, el problema es cuando la estudiante real de intercambio, Miu, aparece.